Ilmuwan dari Baylor College of Medicine di Amerika Serikat telah menunjukkan bahwa konsumsi kopi yang sering menyebabkan penurunan risiko penyakit kardiovaskular, diabetes, dan disfungsi hati. Ringkasan penelitian tersedia di situs web American College of Gastroenterology.
Studi tersebut melibatkan 34 orang yang menjalani skrining kolonoskopi dan tidak mengalami perubahan patologis pada usus besar. Relawan menyelesaikan kuesioner yang menunjukkan frekuensi konsumsi kopi. Para ahli mengambil 97 sampel selaput lendir dari berbagai segmen usus pasien dan mengisolasi DNA dari mikroorganisme yang menyusun mikroflora. Kemudian DNA pengkodean RNA ribosom 16S diperluas selama proses amplifikasi, yaitu, salinan tambahan dari gen yang diisolasi dibuat, yang memfasilitasi identifikasi mereka.
Para ilmuwan telah menetapkan urutan nukleotida DNA, menentukan milik mereka dari berbagai kelompok bakteri. Mereka kemudian membandingkan keragaman mikroba dan frekuensi taksa pada asupan kafein tinggi (lebih besar dari 82,9 miligram per hari) dan rendah (kurang dari 82,9 miligram).
Ternyata mereka yang banyak minum kopi memiliki keragaman alfa yang lebih tinggi, yakni keragaman dalam komunitas mikroba, dibanding yang lain. Selain itu, kelompok mikroorganisme pada peminum kopi secara signifikan berbeda dari kelompok mikroorganisme yang hidup di usus peserta yang mengonsumsi sedikit kafein. Jumlah Faecalibacterium dan Roseburia yang memiliki efek antiinflamasi meningkat, sedangkan Erysipelatoclostridium dan Lachnospiraceae yang berpotensi membahayakan menurun. Hubungan ini diamati tanpa memandang usia dan kualitas gizi.
RNA ribosom 16S (16S rRNA) merupakan salah satu komponen utama ribosom (protein sintesis organel sel) pada bakteri dan archaea. Gen yang menyandi 16S rRNA digunakan dalam filogenetik untuk menentukan hubungan evolusioner antara berbagai kelompok mikroorganisme karena rendahnya laju evolusi wilayah DNA ini. Saat ini, database sedang dibuat yang berisi informasi tentang mikroba yang mengandung satu atau varian lain dari gen 16S rRNA.
