Para ilmuwan telah menemukan virus baru di Brasil, yang DNA-nya 90 persen merupakan gen yang tidak diketahui sains. Hasil penemuan dipublikasikan di situs pracetak bioRxiv.
Virus itu terdeteksi di danau buatan Pampulha di kota Belo Horizonte, Brasil. Genomnya yang tidak terlalu kompleks hampir seluruhnya terdiri dari gen yang tidak diketahui sains. Para penulis menamai virus baru Yaravirus brasiliensis setelah nimfa air Yara dari mitologi masyarakat Amerika Selatan.
Para ilmuwan berspekulasi bahwa mereka dihadapkan pada kasus pertama dari kelompok virus terisolasi yang tidak diketahui atau spesies virus raksasa yang jauh yang telah berevolusi menjadi bentuk yang lebih kecil.
Ditemukan hanya pada abad ke-21, virus raksasa mencapai ukuran yang sebanding dengan ukuran sel bakteri. Mereka mendapatkan namanya karena kapsidnya yang besar - membran protein yang membungkus virion - partikel virus. Mereka juga memiliki DNA dengan panjang yang sesuai, yang melebihi 200 ribu pasangan basa dan sering mengandung apa yang disebut orphan, or orphan genes (ORFan), yang tidak ditemukan pada kelompok organisme lain.
Genom kompleks memungkinkan virus raksasa untuk mensintesis protein dan oleh karena itu melakukan perbaikan, replikasi, transkripsi, dan terjemahan DNA. Sebelum penemuan mereka, diyakini bahwa virus tidak memiliki kemampuan seperti itu, karena mereka adalah makhluk diam yang hanya dapat menginfeksi inangnya. Semua virus raksasa yang diketahui adalah parasit amuba.
Dan meskipun ukuran mikroorganisme baru secara signifikan lebih kecil daripada virus raksasa - sekitar 80 nanometer - ia juga berparasit pada amuba, dan genomnya hampir sepenuhnya yatim piatu: 68 gennya (lebih dari 90 persen) tidak menemukan analog dalam organisme yang diketahui, dan hanya enam samar-samar mirip dengan yang dikenal sains.
“Ini karena virus tersebut adalah garis keturunan baru virus amuba dengan asal usul dan filogeni yang menakjubkan,” salah satu pemimpin penelitian, Jônatas Abrahão dari Universitas Federal Minas Gerais di Brasil, mengatakan dalam siaran pers.
Para ilmuwan telah menganalisis lebih dari delapan setengah ribu metagenom, tetapi belum menemukan di antaranya virus yang terkait dengan mikroorganisme baru. Seperti virus lain dari kelompok ini, ia diwakili oleh DNA beruntai ganda, yang panjangnya 44.900 pasang basa dan berisi 74 fragmen pengkode.
Video promosi:
“Dengan menggunakan protokol standar, analisis genetik pertama kami gagal mendeteksi urutan kapsid yang dapat dikenali atau gen virus klasik lainnya pada yaravirus,” jelas Yonatas Abrajao dan pemimpin studi kedua Bernard La Scola dari Universitas Aix-Marseille di Perancis.
Menurut protokol metagenomik resmi, yaravirus bahkan tidak dapat dikenali sebagai agen virus, karena tidak jelas kesamaannya dengan mereka. Para ilmuwan belum bisa mengatakan siapa dia sebenarnya - perwakilan dari kelompok yang sama sekali baru atau keturunan virus raksasa yang entah bagaimana berevolusi menjadi bentuk yang lebih kecil.
“Jumlah protein yang tidak diketahui yang menyusun partikel-partikel yaravirus mencerminkan variabilitas yang ada di dunia virus dan berapa banyak genom virus baru yang belum ditemukan,” para penulis menyimpulkan.
