Peserta konsorsium Genome 10K pada konferensi tahunan, yang sekarang berlangsung di New York, mengumumkan peluncuran proyek internasional "Genome Vertebrata", tugasnya adalah mengumpulkan genom dari semua 66 ribu spesies vertebrata yang hidup di planet saat ini. Gizmodo bercerita lebih banyak tentang tujuan dan sasaran proyek.
Pada tahun 2009, ahli biologi Amerika David Haussler, Oliver Ryder dan Stephen O'Brien mendirikan proyek Genome 10K, yang bertujuan untuk mengurutkan 10.000 genom vertebrata. Awalnya, 55 ilmuwan dari kebun binatang besar, pusat penelitian, dan museum berpartisipasi dalam proyek tersebut. Pada awalnya, tidak jelas berapa lama waktu yang dibutuhkan untuk mengumpulkan genom dengan kualitas yang memadai. Tetapi dengan biaya dan penyederhanaan metode pengurutan, menjadi jelas bahwa proyek akan menyelesaikan tugasnya dalam beberapa tahun. Selama tiga tahun terakhir, peserta proyek telah membandingkan teknologi utama untuk sekuensing DNA dan analisis hasil yang diperoleh untuk memilih salah satu yang akan membuat "genom platinum".
Kemarin, anggota Genome 10K mengumumkan peluncuran Proyek Genom Vertebrata baru, yang bertujuan untuk mengumpulkan genom jantan dan betina dari 66.000 spesies vertebrata. Proyek ini akan melibatkan 150 ilmuwan yang mewakili 50 organisasi dari 12 negara. Menurut salah satu pendiri proyek, Oliver Ryder, sebagai hasilnya, para ahli biologi akan dapat memahami alasan kepunahan spesies, termasuk apakah ada persilangan terkait erat dalam sejarah spesies, "hambatan", akibatnya keragaman genetik spesies tersebut menurun atau penghapusan - mutasi yang dapat "mematikan »Gen yang diperlukan untuk kelangsungan hidup organisme.
Bersamaan dengan pengumuman proyek baru tersebut, para ilmuwan segera mempresentasikan hasil pertama dari pekerjaannya: genom dari 15 spesies vertebrata, termasuk burung beo kakapo owl yang terancam punah, endemik di Selandia Baru, dan platipus Australia. Genom ini dan semua genom lain yang para peneliti rencanakan untuk dikumpulkan akan dipublikasikan di domain publik, di database Genomik Bahtera Nuh.
Para peserta berencana untuk mengurutkan bagian pendek DNA genom dan mengumpulkan dari mereka urutan yang lebih panjang ke seluruh kromosom, dan kemudian "merekatkan" mereka menggunakan algoritma yang dikembangkan khusus untuk proyek tersebut.
Sebelumnya, peneliti mampu membaca genom seseorang pada sequencer saku seukuran smartphone. Perangkat ini memecahkan rekor pembacaan terlama molekul DNA, mampu mengurutkan urutan hingga 882 ribu pasangan basa.
Ekaterina Rusakova
