Terkadang ada keajaiban di dunia yang sulit dijelaskan dari sudut pandang sains, dan muncul versi tentang campur tangan entitas tertentu, yang dalam agama disebut Tuhan, Pencipta, serta entitas berkuasa lainnya. Para ilmuwan telah mencoba menjelaskan misteri Api Kudus sejak lama, percaya bahwa ini mungkin salah satu tipuan terbesar umat manusia. Skeptis sering menggunakan berbagai metode untuk mengesampingkan kemungkinan yang ilahi dan mistik di dunia kita.
Ada beberapa versi asal mula Api Kudus, di antaranya ada teori asal mula alien dan versi proses kimiawi yang mungkin banyak orang tidak mengerti dan percaya pada mukjizat ilahi. Pendeta dari berbagai agama tidak mengizinkan para ilmuwan untuk meneliti berbagai tempat suci dan artefak, tetapi terkadang hal itu benar-benar terjadi. Misalnya, pada tahun 2008 fisikawan Rusia Andrey Volkov berhasil mendekati rahasia Api Suci, tetapi penelitiannya hampir tidak dapat disebut argumen yang mendukung sains, inilah yang dia tulis:
Terlepas dari insiden aneh dengan Volkov, saya tidak benar-benar percaya pada asal mula ilahi dari keajaiban ini. Bagi saya ini adalah tipuan agama bagi orang-orang untuk meyakinkan banyak orang tentang keberadaan dan kuasa Tuhan. Para pekerja gereja sering mengambil langkah seperti itu, tetapi sering kali mencegah para ilmuwan untuk meneliti mukjizat semacam itu.
